由于RU486诞生不过十几年的时间，预后问题尚无法得知，西方研究者提醒该药有可能破坏免疫系统；而国内妇产科医生则忠告，药物流产妇科病并发率达70%。如果将手术流产与药物流产作一番比较，我们不难发现：两者在对身体造成的伤害、痛苦和所需要花费的时间，以及将面临的风险几乎是相同的。而在我国药物流产费用要比外科手术费贵3倍～5倍。在实际调查中我们发现，怀孕后愿意选择这种方法流产的女性已经占了一半。
来自医院的数据表明接受过药物流产和手术流产的孕妇比例是1∶3，而且前者的比例还在增加。“维护自尊和隐私权”和“可以不请假休息”是众多女性选择药物流产的主要理由。另外，对某些人来说，接受外科手术完全是被动的，而服药则是主动掌握自己命运的一种方法。但从科学的角度出发，千万不可忽视医生的忠告。 正如执行RU486临床试验的一位国际非盈利研究团体成员所说：“此药并非灵丹妙药，既有好处，也有风险。”事实确实如此，而且如果忽视医生的忠告，风险将会更大，法国就曾发生一位妇女在服药过程中心脏病突发而死的例子；国内也有因宫外孕未按照规范服药造成死亡的病例。